Das Problem löst man, indem man Apple Mail zuerst schliesst und die Datei .mboxCache.plist des betroffenen IMAP-Kontos löscht.
Mit dem folgenden Befehl findet man alle von Mail.app angelegten Dateien mit diesem Namen:
$ find ~/Library/Mail -maxdepth 3 -type f -name .mboxCache.plist
Wer die Dateien gleich löschen möchte:
$ find ~/Library/Mail -maxdepth 3 -type f -name .mboxCache.plist -exec rm '{}' ';'
ACHTUNG: Bitte kopiert den zweiten Befehl auf eigene Verantwortung von hier. Der Befehl LÖSCHT Dateien auf deinem Computer — wenn alles gut geht nur diejenigen Dateien, die hier beschrieben wurden. Ich übernehme aber keine Gewähr..